山東中醫藥大學創建于1958年，1978年被確定為全國重點建設的中醫院校，1981年成為山東省重點高校，1996年經原國家教委批準更名為山東中醫藥大學，是教育部本科教學工作水平評估優秀學校、山東省首批五所應用基礎型人才培養特色名校之一。

　　2007年學校由濟南市歷下區主體遷入扁鵲故里——長清，截至2014年5月，總占地1829畝，建筑面積54.5萬平方米，儀器設備總值17087.6萬元，館藏紙質圖書110萬冊、電子圖書47萬冊。學校有3所直屬附屬醫院、11所非直屬附屬醫院、22所教學醫院、50余處臨床教學基地和10家山東省研究生聯合培養基地。

　　截至2015年10月，學校有13個二級學院，下設21個本科專業，涉及醫、理、文、工、管等學科門類;有3個博士后科研流動站、3個博士學位授權一級學科、8個碩士學位授權一級學科。學校有全日制在校生近21000人，其中本專科生18100余人，研究生近2600人。